Les analyses
Le catalogue des analyses répertorie toutes les informations concernant les analyses réalisées au SBTT.
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Type d'analyses et méthodes d'analyses*
(cliquer sur la pathologie pour visualiser les méthodes d'analyses correspondantes)
1- Cancer du poumon métastatique non à petites cellules
4- Mélanome
5- Tumeurs cérébrales
6-Cancer papillaire de la thyroïde
7-Tumeurs du rein
8-Tumeurs du foie
9-Lymphomes
10-Tumeurs pédiatriques
11-Mastocytoses
* Listes des gènes dans les panels NGS disponibles :
- Panel NGS cibles INCa (colon/poumon/mélanome)
- Panel Archer® FUSIONPlex® CTL (Comprehensive Thyroid & Lung)
- Panel Archer® FUSIONPlex® Core Solid Tumor
- Panel Archer® FUSIONPlex® Pan Solid Tumor
- Panel TSO500 Illumina (524 gènes + TMB + MSI)
- Panel NGS Lymphome B
- Panel NGS Lymphome T
- Panel Recombinaison Homologue / BRCA
- Panel Targeted Avenio ctDNA- 17 gènes
- Panel Expanded Avenio ctDNA - 77 gènes
Pour plus de renseignements, vous pouvez contacter le SBT :
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La Prescription
Le mode de prescription diffère selon les analyses demandées :- Recherche d'anomalies moléculaires et/ou cytogénétiques dans le cadre
des thérapies ciblées (INCa) : fiche de prescription d'analyses
moléculaires générale
- Recherche d'anomalies moléculaires et/ou cytogénétiques hors cadre des thérapies ciblées (INCa) : fiche de prescription d'analyses moléculaires générale ou bon interne du CHU
- Recherche de mutations dans ADN tumoral circulant : fiche de prescription ADNct (fiche information ADNct)
- Congélation pour inclusion en Tumorothèque sanitaire : Fiche d'identification du prélèvement
Les fiches de prescription doivent être complétées et transmises avec le prélèvement.
Elles sont téléchargeables sur Plateformes de Génétique Moléculaire des Cancers - Onco-Nouvelle-Aquitaine
Aucune demande orale n'est acceptée.
Tout échantillon biologique non identifié est déclaré non-conforme dès réception au laboratoire.
Les informations présentes sur la demande et le prélèvement doivent obligatoirement être concordantes.
(cliquer sur la nature d'analyse pour visualiser le matériel autorisé à transmettre)
- Recherche de mutations somatiques et fusions/réarrangements de gène par analyse moléculaire
- Étude des réarrangements des gènes des récepteurs lymphocytaires par analyse moléculaire
- Recherche de réarrangements moléculaires par technique FISH
- Analyse SNP Array
- Analyse de la méthylation d'un gène par technique moléculaire
- Classification des lymphomes par analyse RT-MLPSEQ
- Congélation pour conservation en Tumorothèque sanitaire
Conservation et acheminement des échantillons
Les modalités de transport doivent permettre :La confidentialité de l'identité du patient prélevéLes transports peuvent être réalisés par :
L'intégrité de l'échantillon
La sécurité des personnes le transportant (triple emballage)
Navettes entre hôpitaux du CHU de Bordeaux
Services postaux
Transporteurs privés
En cas de demande d'analyse urgente
- S'assurer au préalable que le prélèvement a bien été transmis au laboratoire.
- Contacter le laboratoire pour préciser l'urgence du résultat et connaitre le jour prévisionnel du résultat. En fonction des contraintes techniques, le laboratoire évaluera la possibilité de programmer l'analyse afin que le résultat soit disponible le plus rapidement.
- Un numéro de fax et coordonnées du médecin peuvent être précisés afin que le résultat soit transmis dès signature du résultat.
Diffusion des résultats
Importance de la messagerie sécurisée pour recevoir le CR dans des délais courts et de façon sécurisée1- Pour les demandes internes : transmission automatisée sur le serveur patient DXCARE du CHU de Bordeaux
2- Pour les demandes réalisées par les pathologistes du CHU : transmission du format papier qui associe son compte-rendu anatomo-pathologique pour envoi des résultats au clinicien.
3- Pour les demandes externes :
- Envoi immédiat par messagerie sécurisée (MSSanté) au laboratoire expéditeur du prélèvement et aux cliniciens identifiés sur le bon de prescription
- Envoi par courrier au laboratoire expéditeur du prélèvement : double du compte-rendu et renvoi du matériel (bloc et lames) transmis.
- Envoi par courrier aux différents cliniciens nommés sur la prescription : double du compte-rendu
- Envoi immédiat par messagerie sécurisée (MSSanté) au laboratoire expéditeur du prélèvement et aux cliniciens identifiés sur le bon de prescription
- Envoi par courrier au laboratoire expéditeur du prélèvement : double du compte-rendu et renvoi du matériel (bloc et lames) transmis.
- Envoi par courrier aux différents cliniciens nommés sur la prescription : double du compte-rendu
Cas particulier des correspondants d'outre-mer (prescripteur, laboratoire) un double du compte-rendu validé peut être faxé sur demande.
Aucun résultat n'est transmis par téléphone ou directement au patient