Le Centre de Ressources Biologiques (CRB) Cancer réceptionne, conserve et met à disposition des collections de tumeurs solides (Filière Tissus) et liquides (Filière Hématologie). Il participe également à la prise en charge des échantillons biologiques inclus dans les protocoles académiques et industriels.
Il est certifié selon la norme NF S96-900 depuis 2013.
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PRéSENTATION
origine des ressources biologiques
- Les blocs paraffine sont conservés à température ambiante.
Prestations proposées et méthodes associées par le CRB-Cancer
Le CRB-Cancer partage les locaux avec le Service de Biologie des Tumeurs
- Tumorothèque et le Service d'Hématologie Moléculaire, qui sont
accrédités selon la norme ISO 15189 depuis 2015. Une collaboration facilitée peut être mise en place pour disposer de prélèvements avec annotations moléculaires (anomalies moléculaires détectées par NGS, CGH array, analyses de fragments, PCR digitale)
T=tumeurs
distribution a des Équipes de recherche
Nature des ressources biologiques conservées
Présentation du CRB-Cancer
Le CRB-Cancer du CHU de Bordeaux a été créé en 2003.
Le CRB-Cancer est implanté à l'hôpital Haut-Lévêque au Groupe Hospitalier Sud. Il s'inscrit dans la Fédération de Cancérologie du CHU de Bordeaux et du Cancéropôle Grand Sud-Ouest ; il est répertorié au sein du réseau national des Biobanques.
Le CRB-Cancer est intégré au Pôle de Biologie Pathologie (PBP) du CHU de Bordeaux et comprend deux filières :
-Filière « Tissus » : cette filière gère les tumeurs solides et les liquides associés.
-Filière « Hématologie » : cette filière gère les prélèvements sanguins et/ou médullaires d'hémopathies malignes.
Le CRB-Cancer est implanté à l'hôpital Haut-Lévêque au Groupe Hospitalier Sud. Il s'inscrit dans la Fédération de Cancérologie du CHU de Bordeaux et du Cancéropôle Grand Sud-Ouest ; il est répertorié au sein du réseau national des Biobanques.
Le CRB-Cancer est intégré au Pôle de Biologie Pathologie (PBP) du CHU de Bordeaux et comprend deux filières :
-Filière « Tissus » : cette filière gère les tumeurs solides et les liquides associés.
-Filière « Hématologie » : cette filière gère les prélèvements sanguins et/ou médullaires d'hémopathies malignes.
Le CRB-Cancer est historiquement rattaché au Service de Biologie des Tumeurs - Tumorothèque (SBTT) du CHU de Bordeaux qui, avec les secteurs "cytogénétiques et biologie moléculaire" du service d'Hématologie Biologique, forme un plateau technique commun de génétique somatique des tumeurs et des hémopathies implanté dans des locaux communs.
Depuis Janvier 2019, ces différentes entités sont regroupées au sein du Plateau Cellules-Tissus (PCT) qui intègre également le service de Pathologie et l'ensemble des activités d'hématologie biologique spécialisée.
Cette organisation permet de gérer, pour un même prélèvement, l'ensemble des analyses et activités de conservation à but sanitaire et recherche dans le respect des contraintes règlementaires, de traçabilité (logiciel Tumorotek et base Access- déclarés à la CNIL) et d'anonymisation pour les travaux de recherche, sous réserve du consentement du patient.
Depuis Janvier 2019, ces différentes entités sont regroupées au sein du Plateau Cellules-Tissus (PCT) qui intègre également le service de Pathologie et l'ensemble des activités d'hématologie biologique spécialisée.
Cette organisation permet de gérer, pour un même prélèvement, l'ensemble des analyses et activités de conservation à but sanitaire et recherche dans le respect des contraintes règlementaires, de traçabilité (logiciel Tumorotek et base Access- déclarés à la CNIL) et d'anonymisation pour les travaux de recherche, sous réserve du consentement du patient.
Les activités de préparation et conservation des échantillons biologiques humains en vue de leur cession pour un usage scientifique sont déclarées et autorisées par le Ministère de l'Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l'Innovation.
Organisation de la gouvernance du CRB-Cancer
origine des ressources biologiques
Les prélèvements inclus dans le CRB-Cancer peuvent provenir de diverses origines et sous certaines conditions
A partir de ces échantillons, des produits dérivés peuvent être préparés (ADN, ADN circulant, ARN, ADNc) ainsi que des lames (blanches, colorées).
NATURE DES RESSOURCES BIOLOGIQUES CONSERVÉES AU CRB-CANCER
Les tissus congelés- Ils proviennent de tissus frais (pièces opératoires ou biopsies) ou de tissus immergés dans le RNA Later (origine tracée pour chaque échantillon).
Prélèvement immergé dans le RNA Later
- Ils sont conservés dans des cryotubes à -140°C ou -80°C.
Echantillons congelés
Les tissus fixés ou blocs paraffine- Les biopsies ou pièces opératoires (coupées en petits fragments) sont fixés dans le formol puis placés dans des cassettes et inclus en paraffine. On les appelle également « blocs paraffine » ou « blocs FFPE ».
- Les blocs paraffine sont conservés à température ambiante.
Prélèvements fixés et inclus dans un bloc de paraffine
Les fractions sanguines et médullaires- A partir des tubes de sang réceptionnés au laboratoire, différents conditionnements peuvent être préparés : sérum, plasma, buffy coat, cellules mononucléées, sang total.
- A partir des tubes de moelle réceptionnés au laboratoire, différents conditionnements peuvent être préparés : buffy coat, cellules mononucléées et moelle totale.
- Les fractions sanguines et médullaires sont aliquotées dans des microtubes de 1.5ml et sont conservées à -80°C.
Fractions sanguines
Des produits dérivés peuvent être préparés à partir des tissus ou tubes de sang ou de moelle : ADN, ADN circulant, ARN, ADNc
- Les ADN et ADNc sont conservés à -20°C.
- Les ARN sont conservés à -80°C.
- Les ADN circulants sont conservés à -20°C. (Il est conseillé de les analyser dès leur extraction du plasma).
- Les ADN et ADNc sont conservés à -20°C.
- Les ARN sont conservés à -80°C.
- Les ADN circulants sont conservés à -20°C. (Il est conseillé de les analyser dès leur extraction du plasma).
Des lames peuvent être préparées à partir des tissus congelés ou fixés : lames blanches ou lames colorées (HES)
Les lames sont conservées à température ambiante.
Les lames sont conservées à température ambiante.
Lame colorée prête pour observation au microscope
Toutes les enceintes de conservation sont cartographiées et sont sous alarme avec sondes étalonnées.
Les alarmes sont en lien direct avec le service de sécurité de l'Hôpital Haut-Lévêque, garantissant une intervention 24h/24. En cas de panne, des enceintes de secours (-140°, -80°, -20°, +5°C vides) sont disponibles au sein du CRB-Cancer permettant un transfert rapide et sécurisé des ressources biologiques.
Filière Tissus (inclus les tissus congelés et fractions sanguines associées)
T=tumeursFilière Hématologie
distribution a des Équipes de recherche
Les distributions à des équipes de recherche sont effectuées par le CRB-Cancer si les conditions suivantes sont réunies :
En 2019 :
- Demande formulée par l'équipe de recherche avec descriptif du projet de recherche
- Instruction de la demande par le service juridique de la DRCI (Direction de la Recherche Clinique et de l'Innovation) du CHU de Bordeaux
- Signature d'un contrat précisant les engagements de l'équipe de recherche et du CRB-Cancer
Le CRB-Cancer garantit :
- uniquement la distribution des échantillons dont les patients ont signé un consentement
- l'anonymat des ressources biologiques et des données associées : les équipes de recherche ne peuvent pas connaitre l'identité des patients.
En 2019 :
- Le CRB-Cancer a distribué un total de 7890 échantilons
- Les échantillons ont été envoyés à des équipes de recherche travaillant pour l'INSERM, l'université, les centres hospitaliers, institut de recherche en Cancérologie et entreprise de Biotechnologie. Ces différentes équipes se situent à Bordeaux, Paris, Créteil, Le Kremlin Bicêtre, Villejuif, Angers, Montpellier, Toulouse, étranger (Etats Unis).
Le CRB-Cancer participe, étroitement avec des industriels et des équipes de recherche, à la mise en place de protocoles et à leur prise en charge. Selon les demandes et les besoins des promoteurs, le CRB Cancer peut intervenir à plusieurs niveaux dans le cadre de protocoles : réception des prélèvements, préparation technique, aliquotage, stockage (-20°c, -80°C et/ou -140°C, sous surveillance continue) et envoi des échantillons biologiques.
Le CRB Cancer est impliqué dans une démarche qualité (certification NF S96-900) et collabore étroitement avec les services de biologie moléculaire accrédités COFRAC 15189 pour la partie analytique. L'ensemble des étapes est tracé dans des logiciels et/ou documents spécifiques.
Le CRB Cancer est impliqué dans une démarche qualité (certification NF S96-900) et collabore étroitement avec les services de biologie moléculaire accrédités COFRAC 15189 pour la partie analytique. L'ensemble des étapes est tracé dans des logiciels et/ou documents spécifiques.
publication des travaux de recherches
Les ressources biologiques distribuées par le CRB Cancer ont fait l'objet de nombreux travaux scientifiques qui ont été publiés dans différentes revues scientifiques sous forme d'articles.
Le CRB-Cancer est partenaire de nombreux réseaux nationaux au sein desquels il collecte des échantillons et données associées, selon les recommandations spécifiques de chaque réseau.
Ces réseaux se nomment également BCB : Bases Clinico-Biologiques.
Ces réseaux se nomment également BCB : Bases Clinico-Biologiques.